Comment obtenir, sécuriser et optimiser sa déclaration CII (Crédit d’Impôt Innovation)
Guide complet 2026 pour dirigeants de PME/PMI, responsables R&D et start-ups innovantes pour comprendre, sécuriser et optimiser votre déclaration CII
- décembre 2, 2025
- Frédéric REY
- 9:00 am
Introduction
Votre entreprise innove… mais profite-t-elle pleinement du Crédit d’Impôt Innovation ? Alors que le CII permet aux PME de récupérer 20 % de leurs dépenses d’innovation, beaucoup se perdent dans les critères techniques, les preuves à fournir ou la crainte d’un contrôle fiscal. Avec les exigences renforcées en 2026 et la vigilance accrue de l’administration, il devient indispensable de bien optimiser sa déclaration CII pour sécuriser son avantage fiscal.
Dans cet article, vous découvrirez pas à pas comment obtenir, sécuriser et optimiser votre CII grâce à une méthode claire, des exemples concrets et des conseils d’expert.


Plan de l’article
Toggle1. Le CII : qu’est-ce que c’est le crédit impôt Innovation et pourquoi il compte
1.1 Définition et entreprises éligibles
Le CII est un crédit d’impôt réservé aux PME (au sens communautaire) d’activités industrielles, commerciales ou agricoles, imposées à l’IS (Impôt sur les Sociétés) ou à l’IR (Impôt sur le Revenu). Il s’applique lorsque l’entreprise réalise des opérations de conception de prototypes ou d’installations pilotes de produits nouveaux.
Le dispositif vise uniquement les entreprises de moins de 250 salariés avec un CA < 50 M€ ou un bilan < 43 M€, ce qui en fait l’un des outils fiscaux les plus accessibles pour soutenir l’innovation des PME.
1.2 Pourquoi il est stratégique
Pour une PME, le CII permet de « monétiser » une part de ses dépenses d’innovation : design, prototype, tests, pilotage… Cela renforce la trésorerie, soutient l’innovation et accélère la mise sur le marché.
Le CII est particulièrement utile dans les secteurs industriels où le coût de développement d’un nouveau produit (matériaux, essais, ingénierie) peut être significatif.
2. Qui peut bénéficier du CII ?
Le Crédit d’Impôt Innovation est réservé aux PME au sens communautaire, mais il est également accessible à certaines entreprises bénéficiant de dispositifs d’exonération.
Peuvent bénéficier du CII :
- Les PME industrielles, commerciales ou agricoles soumises à un régime réel d’imposition (IS ou IR),
- les entreprises temporairement exonérées d’impôt, notamment :
- JEI – Jeunes Entreprises Innovantes,
- entreprises créées pour reprendre une société en difficulté,
- entreprises situées dans des zones aidées :
- AFR, ZFU-TE, BER, ZRD, ZRR / France ruralités revitalisation,
- zones franches d’activité des DOM,
- BUD, ZDP.
3. Montants et taux applicables en 2026
- En métropole : taux fixé à 20 % des dépenses éligibles.
- Dans les DOM : taux 60 %.
- En Corse : taux 35 % (ME) et 40 % (PE).
- Plafond de dépenses éligibles : 400 000 € / an.
- Dispositif prorogé jusqu’au 31 décembre 2027.
- Selon le PLF 2026, aucun changement majeur attendu.
4. Quelles dépenses sont réellement éligibles au CII ?
4.1 Dépenses concernées
Conception de prototypes ou installations pilotes : Développement de maquettes fonctionnelles, prototypes physiques ou numériques, essais, itérations, tests techniques.
Amortissements de biens et équipements dédiés : Équipements utilisés exclusivement pour la conception du prototype ou installation pilote.
Dépenses de personnel affecté au projet : Rémunérations + charges des ingénieurs, designers, ergonomes, techniciens mobilisés sur le projet.
(Les heures doivent être justifiées et traçables (feuilles de temps, planning, reporting interne).)
4.2 Dépenses exclues ou conditions importantes
Production industrielle : La fabrication en série, l’industrialisation, les outillages de production ou les coûts commerciaux ne relèvent pas du CII.
Non-cumul avec le Crédit d’Impôt Recherche (CIR) : Une dépense ne peut pas être déclarée deux fois : si elle a été comptabilisée dans le CIR, elle est exclue du CII.
Le produit doit être réellement “nouveau” : Pour être éligible, le produit doit être nouveau pour le marché et présenter des performances supérieures (techniques, ergonomiques, environnementales…) aux produits concurrents.
(Les dépenses marketing, commerciales, graphiques “non techniques” et les redesigns sans amélioration fonctionnelle ne sont jamais éligibles.)
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Par exemple : Une PME développe un nouvelle ligne de congélation éco-énergétique pour l’industrie agroalimentaire. Elle réalise un prototype pilote, mobilise des ingénieurs, teste différents matériaux et effectue plusieurs itérations. Toutes les dépenses liées à la conception, aux tests et au temps de personnel dédié peuvent être déclarées au CII, dans la limite du plafond annuel de 400 000 €.
5. Les critères d’innovation à respecter
5.1 « Produit nouveau » pour le marché
Le produit ne doit pas encore être sur le marché et doit présenter une amélioration fonctionnelle, technique, ergonomique ou environnementale.
5.2 Preuves attendues
- Cahier des charges
- Benchmarks
- Rapports d’essais
- Itérations documentées
- Maquettes / prototypes datés
(L’administration exige désormais des preuves “datées et traçables”, notamment en cas de contrôle.)
5.3 Importance de la documentation
Sans preuves, un contrôle fiscal peut disqualifier l’éligibilité. Il faut prévoir une traçabilité rigoureuse : planning, heures affectées, prestataires, factures.
(Les contrôles CII ont augmenté ces dernières années, selon les retours terrain de cabinets spécialisés.)
6. Obtenir, sécuriser et optimiser sa déclaration CII
6.1 Étape 1 – Obtenir : bien construire le dossier
- Identifier clairement le projet innovant.
- Séparer les dépenses R&D (CIR) des dépenses innovation (CII).
- Vérifier que le prototype ou installation pilote remplit les critères.
- Remplir le formulaire Cerfa n° 2069-A-SD (même que pour le CIR) et joindre les justificatifs.
6.2 Étape 2 – Sécuriser : anticiper les contrôles
- Déposer un rescrit fiscal pour obtenir un avis formel de l’administration sur l’éligibilité.
- Tenir une comptabilité analytique spécifique au projet : heures, factures, prestataires agréés.
- Vérifier l’agrément des sous-traitants (obligatoire pour le CII comme pour le CIR).
6.3 Étape 3 – Optimiser : maximiser l’avantage tout en restant conforme
- Utiliser pleinement le plafond de 400 000 € de dépenses éligibles pour atteindre 20 % d’avantage maximum.
- Structurer la déclaration sur plusieurs années si le projet s’étale.
- Veiller à ce que toutes les dépenses soient bien rattachables au prototype/pilot.
- Mettre en avant la valeur ajoutée : performance technique, éco-conception, ergonomie, autant d’arguments qui sensibilisent l’administration.
- Préparer l’arborescence du dossier numérique (projet > heures > factures) pour faciliter un éventuel contrôle.
6.4 Erreurs les plus fréquentes à éviter
- Confondre production de série et prototype → exclusion.
- Sous-traitant non agréé → dépenses rejetées.
- Absence de documentation technique → redressement possible.
- Dépenses déjà déclarées dans le CIR → double comptabilité interdite.
- Impact innovation mal argumenté → remise en cause de l’éligibilité.
7. Quelles démarches pour demander le CII ?
La demande de CII se fait en même temps que la déclaration fiscale annuelle, via le formulaire 2069-A-SD (le même que pour le CIR), à joindre à votre déclaration de résultats.
Si l’entreprise est soumise à l’Impôt sur les Sociétés (IS) : la déclaration du CII doit être déposée au plus tard le 15ᵉ jour du 4ᵉ mois suivant la clôture de l’exercice, via l’espace professionnel impots.gouv.fr (mode EFI) ou par la téléprocédure EDI-TDFC.
Si l’entreprise est soumise à l’Impôt sur le Revenu (IR) : la déclaration doit être transmise dans les 15 jours suivant le 2ᵉ jour ouvré après le 1ᵉʳ mai, également via l’espace professionnel impots.gouv.fr (EFI) ou via la téléprocédure EDI-TDFC.
8. Comment est utilisé le CII une fois déclaré ?
Le CII vient en réduction de l’impôt dû (IS ou IR).
Si le crédit d’impôt est supérieur à l’impôt dû, l’entreprise peut :
- Reporter le solde non consommé pendant 3 ans
- Demander un remboursement immédiat si elle appartient à l’une des situations suivantes :
- PME
- JEI
- Entreprises en conciliation, sauvegarde, redressement ou liquidation
- Entreprises créées suite à une restructuration, concentration ou reprise.
9. Comment demander un remboursement du CII ?
La demande s’effectue en ligne sur impots.gouv.fr :
- Pour les entreprises à l’IS : via l’espace professionnel, rubrique “Déclarer → Impôt sur les sociétés”.
- Pour les entreprises à l’IR : lors de la déclaration annuelle des revenus via l’espace professionnel.
10. Ce qui change pour le CII en 2026
- Le PLF 2026 ne prévoit pas de modification majeure pour le CII à ce jour.
- Mais vigilance accrue : l’administration et les parlementaires surveillent les dispositifs d’innovation fiscalisés.
- Anticiper l’échéance : le CII est prorogé jusqu’au 31 décembre 2027 pour les dépenses exposées.
- Pour les prestataires de R&D, l’agrément CIR/CII reste un enjeu clé (2025-2026).
11. En quoi AREAD se distingue ?
AREAD accompagne les PME, PMI et start-ups grâce à :
- Diagnostic d’éligibilité
- Construction du dossier technique
- Sécurisation
- Assistance en contrôle
AREAD suit une méthodologie inspirée des exigences du BOFiP, garantissant un niveau de conformité élevé et une optimisation réaliste du crédit.
Conclusion
Le CII est un levier puissant pour financer l’innovation. Pour en tirer pleinement parti, il faut :
- Bien identifier les dépenses éligibles
- Construire un dossier solide
- Sécuriser les preuves et les agréments
- Optimiser les dépenses rattachées au prototype
Un accompagnement expert réduit considérablement les risques de rejet et maximise le montant déclaré.
Contactez AREAD pour un diagnostic gratuit de votre projet innovation.
FAQ
Toutes les questions ne sont pas évidentes : voici les réponses aux plus courantes.
Un prototype est un modèle technique fonctionnel qui permet de tester et valider les performances du futur produit, même s’il n’a pas encore sa forme finale. Il doit démontrer que le produit apporte une performance supérieure par rapport à ce qui existe déjà sur le marché.
Une installation pilote désigne un ensemble d’équipements ou de dispositifs testés dans des conditions proches d’un usage industriel réel. Son objectif est de vérifier que le nouveau produit fonctionne comme prévu et qu’il apporte une amélioration mesurable par rapport aux solutions déjà commercialisées.
Un produit est considéré comme « nouveau » s’il n’est pas encore disponible sur le marché et s’il présente des performances supérieures (techniques, ergonomiques, environnementales ou fonctionnelles) par rapport aux produits existants. Cette amélioration doit être objective et justifiable.
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