Thèse CIFRE (ANRT) : comment fonctionne ce dispositif et pourquoi l’activer en 2026 ?

Recruter un profil très qualifié, structurer un projet de R&D et réduire significativement son coût : est-ce vraiment possible pour une PME ou une start-up innovante ?

Introduction

La thèse CIFRE entreprise (Convention Industrielle de Formation par la Recherche) s’impose comme un levier stratégique de financement de la R&D.
Preuve de son importance : la France vise 2 150 thèses CIFRE par an d’ici 2027 (contre 1 500 en 2020), selon l’article de la MESR.

Ce dispositif permet à une entreprise de recruter un doctorant pour mener des travaux de recherche en lien direct avec ses enjeux, tout en bénéficiant :

  • D’une subvention annuelle de l’ANRT
  • Et d’une éligibilité au Crédit d’Impôt Recherche (CIR)

Dans cet article, nous vous expliquons comment fonctionne la thèse CIFRE, quels sont ses bénéfices concrets, et comment l’activer efficacement pour vos projets.

Travaux de recherche universitaire à l’origine d’une Jeune Entreprise Universitaire

1. La thèse CIFRE : de quoi parle-t-on exactement ?

La thèse CIFRE repose sur une collaboration tripartite entre :

  • Une entreprise
  • Un laboratoire de recherche public
  • Et un doctorant, salarié de l’entreprise

L’objectif est clair : faire le lien entre recherche académique et besoins industriels, en intégrant la recherche au cœur de la stratégie de l’entreprise.

Le doctorant mène ses travaux de thèse en lien avec un laboratoire, tout en travaillant majoritairement au sein de l’entreprise sur des problématiques concrètes, directement applicables.

1.1 Les trois types de thèses CIFRE

Il existe aujourd’hui trois déclinaisons du dispositif :

  • CIFRE “générale”, ouverte à tous les secteurs et disciplines,
  • CIFRE Défense, pour des projets présentant un intérêt stratégique spécifique,
  • CIFRE Brésil, dédiée à certains projets scientifiques et techniques avec des chercheurs brésiliens.

Dans la grande majorité des cas, les entreprises mobilisent la CIFRE générale.

2. Pourquoi la thèse CIFRE est un levier stratégique pour les entreprises

La thèse CIFRE ne se limite pas à un dispositif académique. C’est avant tout un outil de structuration de la R&D.

2.1 Accélérer et sécuriser les projets de R&D

Intégrer un doctorant permet :

  • D’approfondir des verrous technologiques
  • De tester de nouvelles approches
  • De structurer une démarche de recherche au sens du CIR

Le doctorant contribue activement à l’innovation de l’entreprise, en lien direct avec ses besoins opérationnels.

2.2 Une subvention annuelle de l’ANRT

L’Association Nationale de la Recherche et de la Technologie (ANRT) verse à l’entreprise une subvention de 14 000 € par an pendant trois ans, soit 42 000 € au total.

En contrepartie, l’entreprise s’engage à :

  • Recruter le doctorant en CDD de 3 ans ou en CDI,
  • Lui verser une rémunération brute annuelle minimale de 23 484 €,
  • Lui confier une mission de recherche clairement définie.

2.3 Une compatibilité directe avec le Crédit d’Impôt Recherche (CIR)

Les travaux réalisés dans le cadre d’une thèse CIFRE sont éligibles au Crédit d’Impôt Recherche.

La présence d’un doctorant CIFRE constitue par ailleurs un indicateur fort de R&D, souvent apprécié lors des contrôles fiscaux, ce qui permet de sécuriser les déclarations de CIR.

2.4 Un financement global très avantageux

En combinant :

  • La subvention ANRT,
  • Le Crédit d’Impôt Recherche,
  • Et éventuellement le statut JEI,

Une entreprise peut financer plus de 60 % du coût du doctorant.

3. Quels bénéfices pour le doctorant et le laboratoire ?

3.1 Pour le doctorant

La CIFRE permet De mener une thèse financée sur des problématiques concrètes avec une forte employabilité à l’issue du doctorat.

3.2 Pour le laboratoire

La CIFRE :

  • Renforce les liens avec le tissu économique
  • Facilite l’accès à des données industrielles
  • Contribue à la production scientifique (publications, brevets)

4. Quelles sont les conditions d’éligibilité ?

Le dispositif CIFRE repose sur des critères précis.

4.1 Côté entreprise

L’entreprise doit :

  • Être de droit français
  • Être à jour de ses obligations fiscales et sociales
  • Démontrer un véritable intérêt pour la recherche
  • Et avoir la capacité de collaborer activement avec un laboratoire public

4.2 Côté doctorant

Le candidat doit :

  • Être titulaire d’un Master 2
  • Ne pas être inscrit en thèse depuis plus de 9 mois
  • Ne pas avoir été salarié de l’entreprise plus de 9 mois (hors stages et apprentissage)

4.3 Côté laboratoire

Le laboratoire doit :

  • Appartenir à un établissement public de recherche
  • Garantir un encadrement scientifique de qualité
  • S’inscrire dans une collaboration structurée avec l’entreprise

5. Comment mettre en place une thèse CIFRE ?

La mise en œuvre d’une CIFRE repose sur trois contrats :

  1. Un contrat de travail entre l’entreprise et le doctorant
  2. Un contrat de collaboration entre l’entreprise et le laboratoire
  3. Un contrat de thèse entre le doctorant et le laboratoire

 

Le dossier CIFRE comprend notamment :

  • Le projet scientifique
  • Les engagements des trois parties
  • Les documents académiques du candidat
  • Une présentation détaillée de l’entreprise et du laboratoire

Le dépôt s’effectue en ligne sur la plateforme de l’ANRT, tout au long de l’année, dans un délai maximal de 9 mois après l’embauche. L’instruction prend en moyenne 3 mois.

Conclusion

En conclusion, la thèse CIFRE entreprise est un dispositif structurant pour :

  • Renforcer la R&D,
  • Recruter des profils hautement qualifiés
  • Optimiser les coûts grâce aux financements publics
  • Et sécuriser le recours au Crédit d’Impôt Recherche

C’est toutefois un dispositif technique, qui nécessite une bonne compréhension des critères d’éligibilité et des règles de cumul.

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